Cada participante recibe líneas de crédito por parte del resto de los participantes del sistema. Las siguientes son algunas de las reglas más importantes para las líneas de crédito: 1) el participante puede sobregirar su cuenta hasta por el monto total de las líneas de crédito que recibe y 2) Banco de México fija límites para cada participante sobre el monto de las líneas que puede extender a un solo participante y al monto total de las líneas que puede extender. Estos límites dependen del tamaño del banco.

El sistema cuenta con un esquema de repartición de pérdidas para el caso en que un participante no cumpla con la liquidación al final del día. Al monto que le corresponde aportar a cada participante que haya otorgado línea de crédito al participante incumplido se le conoce como "Obligación Adicional de Liquidación".